Pixellisation sur HDD multimedia

Bonjour à tous,
J'ai un souci de pixellisation, mais pas sur tous les supports.
Je m’explique.
Je monte un film (30 minutes max).
Source : Full HD 50i de mon camescope sony, importé du disque dur du camescope directement au HDD du PC.
Montage, application des transition, titre, effet, etc.
Export via AS en AVCDH (HDD) (patch H264 installé après MAJ en 1.1).
Le résultat : OK sur PC (VLC et WMP), ok si après j'utilise le fichier encodé pour réalisé un DVD, mais PAS OK si je lis le fichier sur mon Pop Corn Hour (souvent des carrés de pixels, voires des carrés de pixels verts).
Après plusieurs encodages différents (fichiers de rendus effacés, rendu complet avant export), ces pixels verts apparaissent toujours aux mêmes endroits. Le fichier source du caméscope mis sur mon pop corn passe sans aucun problème.

J'ai monté 15 épisodes cet été de la vie de toutes la petite famille, et je n'ai pas de Blueray, je veux utiliser mon pop corn pour stocker et regarder mes vidéos.

Avez-vous un conseil avisé en la matière ?
Merci par avance.

Junior