Jvc everio 3d et post-prod

Bonjour à tous,

Après de nombreuses heures de recherches infructueuses, je donne ma langue aux chats du repaire.
Je dispose donc de rushes tournés en 3d relief avec la camera jvc everio 3d (réf:GS-TD1BEU). Le format d'enregistrement est le mp4 avec comme codec le mvc en entrelacé et full hd (le side by side pour cettte camera se fait en 960*1080).
Il s'agit donc d'inclure l'acteur filmé sur fond vert dans un décor de synthèse.
Avec mvc to avi converter, je parviens a récuperer les flux droit et gauche séparés en avi non compressé.
C'est a partir de la que les soucis commencent: les images des deux flux semblent entrelacées et ce, quelque soit la méthode d'imterpretation du metrage que j'emploie.
J'ai effectué des captures d'écran afin que vous puissiez bien vous rendre compte du soucis.

tout d'abord l'import brut:


la trame supérieure en premier:


la trame inférieure en premier:


Comme vous pouvez le constater, le tramage , meme si il est un peu atténué , ne disparait pas dans tous les cas de figure.
Puissent les dieux du signal repecher ma bouteille à la mer!