La solution 1) de Plugman est à mon avis la meilleure.
Tu exportes ta séquence sous la forme d'une suite d'images et tu utilises un programme de manipulation d'images comme Photoshop.
Je te conseille d'essayer The GIMP :
http://www.gimp.org
qui est un logiciel libre, au départ fait pour Linux, mais dont une version Win32 existe.
Sinon, il existe un soft qui sait lire directement les fichiers AVI, donc sans avoir à passer par un export, c'est Corel Photopaint. Ce que Photoshop, curieusement, ne sais pas faire.
Entre Premiere et Photoshop, il existe un format d'échange nommé FilmStrip (je crois) mais qui n'apporte apparement rien de plus par rapport à un export d'une suite d'images...
Et After Effect est un logiciel finalement très limité et jusqu'à une version récente, il n'avait aucun outil pour retoucher une image à la main ! (Histoire d'obliger les gens à acheter Photoshop en plus j'imagine...)
Lionel